MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Leptospira interrogans serovar Copenhageni str. Fiocruz L1-130 chromosome II

Total Repeats: 5571

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_005824	TGAA	2	8	12	19	50 %	25 %	25 %	0 %	45655586
2	NC_005824	AAATC	2	10	67	76	60 %	20 %	0 %	20 %	45655586
3	NC_005824	TCAA	2	8	184	191	50 %	25 %	0 %	25 %	45655586
4	NC_005824	TTCA	2	8	199	206	25 %	50 %	0 %	25 %	45655586
5	NC_005824	T	7	7	224	230	0 %	100 %	0 %	0 %	45655586
6	NC_005824	A	6	6	316	321	100 %	0 %	0 %	0 %	45655586
7	NC_005824	TC	3	6	414	419	0 %	50 %	0 %	50 %	45655586
8	NC_005824	TGGT	2	8	524	531	0 %	50 %	50 %	0 %	45655586
9	NC_005824	GAA	2	6	558	563	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	45655586
10	NC_005824	CCT	2	6	611	616	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	45655586
11	NC_005824	T	7	7	638	644	0 %	100 %	0 %	0 %	45655586
12	NC_005824	TTA	2	6	662	667	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	45655586
13	NC_005824	GAT	2	6	675	680	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	45655586
14	NC_005824	ATT	2	6	695	700	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	45655586
15	NC_005824	GAA	2	6	702	707	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	45655586
16	NC_005824	ACGT	2	8	763	770	25 %	25 %	25 %	25 %	45655586
17	NC_005824	AGTT	2	8	778	785	25 %	50 %	25 %	0 %	45655586
18	NC_005824	A	8	8	801	808	100 %	0 %	0 %	0 %	45655586
19	NC_005824	ACAA	2	8	876	883	75 %	0 %	0 %	25 %	45655586
20	NC_005824	GGTCT	2	10	922	931	0 %	40 %	40 %	20 %	45655586
21	NC_005824	TGC	2	6	968	973	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	45655586
22	NC_005824	TCAA	2	8	977	984	50 %	25 %	0 %	25 %	45655586
23	NC_005824	CGGAGA	2	12	1040	1051	33.33 %	0 %	50 %	16.67 %	45655586
24	NC_005824	AAG	2	6	1057	1062	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	45655586
25	NC_005824	GGCT	2	8	1129	1136	0 %	25 %	50 %	25 %	45655586
26	NC_005824	ATG	2	6	1177	1182	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	45655586
27	NC_005824	ACG	2	6	1273	1278	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	45655586
28	NC_005824	A	6	6	1302	1307	100 %	0 %	0 %	0 %	45655586
29	NC_005824	GAT	2	6	1368	1373	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	45655586
30	NC_005824	ACT	2	6	1392	1397	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	45655586
31	NC_005824	A	6	6	1424	1429	100 %	0 %	0 %	0 %	45655586
32	NC_005824	GAA	2	6	1434	1439	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	45655586
33	NC_005824	AAG	2	6	1537	1542	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	45655586
34	NC_005824	GTT	2	6	1644	1649	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	45655586
35	NC_005824	GAC	2	6	1656	1661	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	45655586
36	NC_005824	TCC	3	9	1793	1801	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	45655586
37	NC_005824	GAA	2	6	1825	1830	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	45655586
38	NC_005824	GAG	2	6	1912	1917	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	45655586
39	NC_005824	TTC	3	9	1919	1927	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	45655586
40	NC_005824	TGG	2	6	1976	1981	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	45655586
41	NC_005824	CTT	2	6	2035	2040	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	45655586
42	NC_005824	A	6	6	2120	2125	100 %	0 %	0 %	0 %	45655586
43	NC_005824	T	6	6	2145	2150	0 %	100 %	0 %	0 %	45655586
44	NC_005824	CGG	2	6	2269	2274	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	45655586
45	NC_005824	CTT	2	6	2299	2304	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	45655586
46	NC_005824	CGG	2	6	2434	2439	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	45655586
47	NC_005824	TTC	2	6	2512	2517	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	45655586
48	NC_005824	AAT	2	6	2527	2532	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	45655586
49	NC_005824	TCC	2	6	2604	2609	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	45655587
50	NC_005824	ATT	2	6	2753	2758	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	45655587
51	NC_005824	ATC	2	6	2835	2840	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	45655587
52	NC_005824	AGGAGA	2	12	2883	2894	50 %	0 %	50 %	0 %	45655587
53	NC_005824	A	6	6	2899	2904	100 %	0 %	0 %	0 %	45655587
54	NC_005824	GGT	2	6	2980	2985	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	45655587
55	NC_005824	AGA	2	6	3021	3026	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	45655587
56	NC_005824	GACT	2	8	3063	3070	25 %	25 %	25 %	25 %	45655587
57	NC_005824	T	8	8	3086	3093	0 %	100 %	0 %	0 %	45655587
58	NC_005824	TTAG	2	8	3124	3131	25 %	50 %	25 %	0 %	45655587
59	NC_005824	CTT	2	6	3179	3184	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	45655587
60	NC_005824	TC	3	6	3235	3240	0 %	50 %	0 %	50 %	45655587
61	NC_005824	AAG	2	6	3254	3259	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	45655587
62	NC_005824	GAA	2	6	3274	3279	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	45655587
63	NC_005824	AGA	2	6	3286	3291	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	45655587
64	NC_005824	AG	3	6	3319	3324	50 %	0 %	50 %	0 %	45655587
65	NC_005824	TCAA	2	8	3365	3372	50 %	25 %	0 %	25 %	45655587
66	NC_005824	TTCTTT	2	12	4073	4084	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	45655588
67	NC_005824	GGT	2	6	4089	4094	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	45655588
68	NC_005824	A	6	6	4095	4100	100 %	0 %	0 %	0 %	45655588
69	NC_005824	GTAT	2	8	4237	4244	25 %	50 %	25 %	0 %	45655588
70	NC_005824	TCT	2	6	4254	4259	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	45655588
71	NC_005824	TTCC	2	8	4310	4317	0 %	50 %	0 %	50 %	45655588
72	NC_005824	TC	3	6	4330	4335	0 %	50 %	0 %	50 %	45655588
73	NC_005824	TGT	2	6	4373	4378	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	45655588
74	NC_005824	TTC	2	6	4379	4384	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	45655588
75	NC_005824	CCA	2	6	4385	4390	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	45655588
76	NC_005824	TTC	2	6	4442	4447	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	45655588
77	NC_005824	AAG	2	6	4484	4489	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	45655588
78	NC_005824	GAACCG	2	12	4510	4521	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	45655588
79	NC_005824	AGA	2	6	4554	4559	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	45655588
80	NC_005824	T	7	7	4591	4597	0 %	100 %	0 %	0 %	45655588
81	NC_005824	T	9	9	4615	4623	0 %	100 %	0 %	0 %	45655588
82	NC_005824	T	6	6	4625	4630	0 %	100 %	0 %	0 %	45655588
83	NC_005824	GAAA	2	8	4718	4725	75 %	0 %	25 %	0 %	45655588
84	NC_005824	GCT	2	6	4755	4760	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	45655588
85	NC_005824	CGT	2	6	4777	4782	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	45655588
86	NC_005824	TTC	2	6	4787	4792	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	45655588
87	NC_005824	TGT	2	6	4823	4828	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	45655588
88	NC_005824	GGT	2	6	4831	4836	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	45655588
89	NC_005824	A	6	6	5217	5222	100 %	0 %	0 %	0 %	45655589
90	NC_005824	TCT	2	6	5304	5309	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	45655589
91	NC_005824	A	6	6	5348	5353	100 %	0 %	0 %	0 %	45655589
92	NC_005824	CAA	2	6	5435	5440	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	45655589
93	NC_005824	AGAA	2	8	5471	5478	75 %	0 %	25 %	0 %	45655589
94	NC_005824	TTC	2	6	5518	5523	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	45655589
95	NC_005824	CCT	2	6	5547	5552	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	45655589
96	NC_005824	GAA	2	6	5574	5579	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	45655589
97	NC_005824	ATT	2	6	5629	5634	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	45655589
98	NC_005824	T	6	6	5672	5677	0 %	100 %	0 %	0 %	45655589
99	NC_005824	A	6	6	5692	5697	100 %	0 %	0 %	0 %	45655589
100	NC_005824	ATC	2	6	5703	5708	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	45655589
101	NC_005824	TTTC	2	8	5712	5719	0 %	75 %	0 %	25 %	45655589
102	NC_005824	A	6	6	5727	5732	100 %	0 %	0 %	0 %	45655589
103	NC_005824	TC	3	6	5763	5768	0 %	50 %	0 %	50 %	45655589
104	NC_005824	ATC	2	6	5832	5837	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	45655589
105	NC_005824	TTTC	2	8	5874	5881	0 %	75 %	0 %	25 %	45655589
106	NC_005824	TGGA	2	8	5893	5900	25 %	25 %	50 %	0 %	45655589
107	NC_005824	TTC	2	6	5947	5952	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	45655589
108	NC_005824	GAA	2	6	6033	6038	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	45655589
109	NC_005824	T	6	6	6079	6084	0 %	100 %	0 %	0 %	45655589
110	NC_005824	AGA	2	6	6090	6095	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	45655590
111	NC_005824	GCG	2	6	6100	6105	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	45655590
112	NC_005824	AAC	2	6	6131	6136	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	45655590
113	NC_005824	TCT	3	9	6142	6150	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	45655590
114	NC_005824	AAT	2	6	6193	6198	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	45655590
115	NC_005824	A	8	8	6201	6208	100 %	0 %	0 %	0 %	45655590
116	NC_005824	T	6	6	6318	6323	0 %	100 %	0 %	0 %	45655590
117	NC_005824	CTT	2	6	6336	6341	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	45655590
118	NC_005824	CTC	2	6	6659	6664	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	45655591
119	NC_005824	TC	3	6	6699	6704	0 %	50 %	0 %	50 %	45655591
120	NC_005824	GGA	2	6	6765	6770	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	45655591
121	NC_005824	AAAT	2	8	6776	6783	75 %	25 %	0 %	0 %	45655591
122	NC_005824	CTT	2	6	6870	6875	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	45655591
123	NC_005824	GTA	2	6	7032	7037	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	45655591
124	NC_005824	A	7	7	7060	7066	100 %	0 %	0 %	0 %	45655591
125	NC_005824	AT	4	8	7085	7092	50 %	50 %	0 %	0 %	45655591
126	NC_005824	GAA	2	6	7128	7133	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	45655591
127	NC_005824	AG	3	6	7191	7196	50 %	0 %	50 %	0 %	45655591
128	NC_005824	GAA	2	6	7227	7232	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	45655591
129	NC_005824	A	9	9	7315	7323	100 %	0 %	0 %	0 %	45655592
130	NC_005824	T	7	7	7347	7353	0 %	100 %	0 %	0 %	45655592
131	NC_005824	CTC	2	6	7386	7391	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	45655592
132	NC_005824	A	8	8	7449	7456	100 %	0 %	0 %	0 %	45655592
133	NC_005824	TCAT	2	8	7467	7474	25 %	50 %	0 %	25 %	45655592
134	NC_005824	TAC	2	6	7510	7515	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	45655592
135	NC_005824	TTC	2	6	7554	7559	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	45655592
136	NC_005824	A	6	6	7565	7570	100 %	0 %	0 %	0 %	45655592
137	NC_005824	CTT	2	6	7614	7619	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	45655592
138	NC_005824	GAGAA	2	10	7624	7633	60 %	0 %	40 %	0 %	45655592
139	NC_005824	TTC	2	6	7684	7689	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	45655592
140	NC_005824	T	7	7	7695	7701	0 %	100 %	0 %	0 %	45655592
141	NC_005824	T	6	6	7808	7813	0 %	100 %	0 %	0 %	45655592
142	NC_005824	CTTT	2	8	7895	7902	0 %	75 %	0 %	25 %	45655592
143	NC_005824	TGC	2	6	7933	7938	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	45655592
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154	NC_005824	T	8	8	8632	8639	0 %	100 %	0 %	0 %	45655592
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165	NC_005824	AGA	2	6	9133	9138	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	45655593
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263	NC_005824	AG	3	6	13612	13617	50 %	0 %	50 %	0 %	45655597
264	NC_005824	C	6	6	13621	13626	0 %	0 %	0 %	100 %	45655597
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266	NC_005824	GA	3	6	13716	13721	50 %	0 %	50 %	0 %	45655597
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270	NC_005824	A	6	6	13952	13957	100 %	0 %	0 %	0 %	45655598
271	NC_005824	TA	3	6	13977	13982	50 %	50 %	0 %	0 %	45655598
272	NC_005824	TCTAT	2	10	13986	13995	20 %	60 %	0 %	20 %	45655598
273	NC_005824	ATT	2	6	14008	14013	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	45655598
274	NC_005824	AG	3	6	14040	14045	50 %	0 %	50 %	0 %	45655598
275	NC_005824	GGA	2	6	14067	14072	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	45655598
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406	NC_005824	GTTT	2	8	20619	20626	0 %	75 %	25 %	0 %	45655602
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